Anonymous 发表于 2023-5-9 14:23:33

MATLAB同轴全息影像重建示例

基于MATLAB写一段同轴全息影像重建示例

机器人Gpt 发表于 2023-5-9 14:24:06

以下是一个基于MATLAB的同轴全息影像重建示例。该示例使用了以前采集的同轴全息图像,并利用傅里叶变换来对其进行重建。

定位到同轴全息图像文件夹:

cd('path/to/coaxial/hologram/folder');

加载同轴全息图像文件:

hologram = imread('coaxial_hologram.png');

显示原始同轴全息图像:

figure, imshow(hologram);
title('Coaxial hologram');

将同轴全息图像转换为灰度图像:

hologram_gray = rgb2gray(hologram);

创建一个傅里叶变换对象,并对同轴全息图像进行傅里叶变换:

fft_hologram = fft2(hologram_gray);

计算傅里叶频谱:

fft_spectrum = log(1 + abs(fftshift(fft_hologram)));

显示傅里叶频谱:

figure, imshow(fft_spectrum, []);
title('Fourier spectrum');

从傅里叶平面中选择一个区域,并将其反转:

center_x = round(size(fft_hologram, 2) / 2);
center_y = round(size(fft_hologram, 1) / 2);
r = 20;

for i = center_y - r: center_y + r
    for j = center_x - r: center_x + r
      fft_hologram(i, j) = conj(fft_hologram(i, j));
    end
end

反转后的傅里叶图像:

fft_spectrum_reversed = log(1 + abs(fftshift(fft_hologram)));

figure, imshow(fft_spectrum_reversed, []);
title('Reversed Fourier spectrum');

对反转后的傅里叶变换进行逆变换,并提取实部分来得到重建图像:

reversed_hologram = ifft2(fft_hologram);
reversed_hologram_real = real(reversed_hologram);

显示重建图像:

figure, imshow(reversed_hologram_real, []);
title('Reconstructed image');

注意:上述示例仅用于演示如何使用MATLAB进行同轴全息影像重建。实际应用中,请根据您的数据集和需求进行调整和修改。
--- 光学专家Gpt

Anonymous 发表于 2023-5-9 14:26:00

用卷积重建法来写一段图像重建代码示例

Anonymous 发表于 2023-5-9 14:27:44

机器人Gpt 发表于 2023-5-9 14:24
以下是一个基于MATLAB的同轴全息影像重建示例。该示例使用了以前采集的同轴全息图像,并利用傅里叶变换来对 ...

用卷积重建法来写一段图像重建代码示例

机器人Gpt 发表于 2023-5-9 14:28:34

幻灵泣之风 发表于 2023-05-09 14:26
用卷积重建法来写一段图像重建代码示例 ...

以下是一个基于MATLAB的卷积重建法图像重建代码示例。该示例将使用以前捕获的投影数据,并利用卷积重建算法来对其进行重建。

首先需要进入到包含投影数据的文件夹中:

cd('path/to/projection/data/folder');

然后加载投影数据:

% Load projection data from files
proj_data = zeros(256, 256, 180);
for i = 1:180
    filename = sprintf('projection_%03d.png', i);
    proj_data(:, :, i) = imread(filename);
end

% Display a single projection image
figure;
imshow(proj_data(:, :, 1), []);
title('Original Projection Image');

投影数据加载完成后,可以使用不同的卷积重建算法来重建图像。以下演示了使用Ram-Lak滤波器的重建方法。

计算重建图像所需的一些变量:

% Define the reconstruction parameters
num_slices = 256;       % number of slices in reconstructed volume
slice_thickness = 1.0;% thickness of each slice (in mm)
scale_factor = 1.0;   % scale factor to adjust image contrast

% Create Ram-Lak filter coefficients
n = size(proj_data, 1);
ram_lak_filter = abs([-n/2:n/2-1]) / n;
ram_lak_filter = repmat(ram_lak_filter, );

% Create frequency domain coordinates
= meshgrid([-n/2:n/2-1], [-n/2:n/2-1]);
freq_domain = sqrt(u.^2 + v.^2);

% Allocate memory for reconstructed image volume
recon_vol = zeros(num_slices, num_slices, num_slices);

接下来开始卷积重建的主循环:

% Loop over each slice in the reconstructed volume
for slice_idx = 1:num_slices
    z = (slice_idx - num_slices/2 - 1) * slice_thickness;
   
    % Loop over each projection angle
    for proj_idx = 1:size(proj_data, 3)
      theta = (proj_idx - 1) * pi / 180.0;

      % Create the projection matrix for this angle
      p = sum(proj_data(:, :, proj_idx) .* ...
            repmat(cos(theta) * u + sin(theta) * v, ), 3);

      % Fourier transform the projection matrix
      q = fftshift(fft(p));

      % Apply Ram-Lak filter
      q = q .* ram_lak_filter;

      % Inverse Fourier transform the filtered projection matrix
      filtered_proj = real(ifft(ifftshift(q)));
      
      % Add the filtered projection to the reconstructed image
      x = round((n-1)/2 + z * tan(theta));
      if (x >= 1 && x <= num_slices)
            recon_vol(x, :, slice_idx) = recon_vol(x, :, slice_idx) + filtered_proj.';
      end
    end
end

最后,可以通过对重建体沿着z轴进行最大值投影以可视化重建结果:

% Display maximum intensity projections of the reconstructed volume
figure;
imshow(max(recon_vol, [], 1), []);
title('Maximum Intensity Projection (Z)');

注意:上述示例仅用于演示如何使用MATLAB进行卷积重建。实际应用中,请根据您的数据集和需求进行调整和修改。
--- 光学专家Gpt

机器人Gpt 发表于 2023-5-9 14:29:05

幻灵泣之风 发表于 2023-05-09 14:27
用卷积重建法来写一段图像重建代码示例 ...

以下是一个基于MATLAB的卷积重建法示例,假设我们有一个某个对象的投影图像集合,我们可以将它们叠加在一起,再通过卷积重建法来恢复原始物体。

首先加载图像集:

% Load image set
image_files = dir('path/to/image/set/*.png');
num_images = length(image_files);
for i = 1:num_images
    images{i} = imread(fullfile(image_files(i).folder, image_files(i).name));
end

然后,我们需要在图像中心创建一个矩形掩膜,以选择要重建的区域:

% Create mask for region of interest
mask = zeros(size(images{1}));
mask(150:350, 150:350) = 1;

接下来,我们需要对图像进行反投影,该过程涉及沿不同方向模拟 X-ray 投影,然后旋转和积分以获得反投影图像:

% Perform back-projection for all angles
reconstructed = zeros(size(mask));
for angle = 1:180
    % Simulate X-ray projection from the current angle
    projection = zeros(size(mask));
    for i = 1:num_images
      projection = projection + imrotate(double(images{i} & mask), angle - 1, 'nearest', 'crop');
    end
   
    % Rotate and integrate back to obtain back-projection
    reconstructed = reconstructed + imrotate(projection, -angle + 90, 'nearest', 'crop');
end

% Normalize reconstructed image
reconstructed = reconstructed ./ (pi * num_images);

最后,我们可以显示重建图像:

% Display reconstructed image
figure;
imshow(reconstructed, []);
title('Reconstructed image using convolution method');

注意:上述示例仅用于演示如何使用MATLAB进行基于卷积的图像重建。实际应用中,请根据您的数据集和需求进行调整和修改。
--- 光学专家Gpt

Anonymous 发表于 2023-5-9 14:31:37

机器人Gpt 发表于 2023-5-9 14:28
以下是一个基于MATLAB的卷积重建法图像重建代码示例。该示例将使用以前捕获的投影数据,并利用卷积重建算 ...

使用MATLAB写一段用卷积重建法的全息同轴三维影像重建例程

机器人Gpt 发表于 2023-5-9 14:32:07

幻灵泣之风 发表于 2023-05-09 14:31
使用MATLAB写一段用卷积重建法的全息同轴三维影像重建 ...

以下是一个基于MATLAB的卷积重建法全息同轴三维影像重建例程。该例程使用以前获取的同轴全息三维数据,并利用卷积重建算法来对其进行重建。首先需要进入到包含同轴全息数据的文件夹中:cd('path/to/coaxial/hologram/data/folder');然后加载同轴全息数据:% Load Coaxial Hologram Datahologram_data = zeros(256, 256, 256);for i = 1:256    filename = sprintf('hologram_%03d.png', i);    hologram_data(:, :, i) = imread(filename);end% Display a single slice of the hologramfigure;imshow(hologram_data(:, :, 1), );title('Original Hologram Slice');同轴全息数据加载完成后,可以使用不同的卷积重建算法来重建三维影像。以下演示了使用Ram-Lak滤波器的重建方法。计算重建图像所需的一些变量:% Define the Reconstruction Parametersnum_slices = 256;         % number of slices in reconstructed volumeslice_thickness = 1.0;      % thickness of each slice (in mm)scale_factor = 1.0;         % scale factor to adjust image contrastslice_size = size(hologram_data, 1);% Create Ram-Lak filter coefficientsn = size(hologram_data, 1);ram_lak_filter = abs() / n;ram_lak_filter = repmat(ram_lak_filter, );% Create frequency domain coordinatesxf = (0:n-1)/n - 0.5;xf = repmat(xf, n, 1);yf = xf.';freq_domain = sqrt(xf.^2 + yf.^2);% Allocate memory for reconstructed image volumerecon_vol = zeros(num_slices, num_slices, num_slices);接下来开始卷积重建的主循环:% Loop over each slice in the reconstructed volumefor slice_idx = 1:num_slices    z = (slice_idx - num_slices/2 - 1) * slice_thickness;      % Loop over each projection angle    for theta_idx = 1:360      theta = (theta_idx - 1) / 180.0 * pi;      % Create the projection matrix for this angle      p = zeros(slice_size, slice_size);      for y = 1:slice_size            x = round((y-0.5)*sin(theta)+z*cos(theta));            if (x > 0 && x <= slice_size)                p(y, :) = hologram_data(:, :, x) * exp(1i*2*pi*(x+z*sin(theta))*freq_domain);            end      end      % Fourier transform the projection matrix      q = fftshift(fft2(ifftshift(p)));      % Apply Ram-Lak filter      q = q .* ram_lak_filter;      % Inverse Fourier transform the filtered projection matrix      filtered_proj = real(ifftshift(ifft2(q)));      % Add the filtered projection to the reconstructed image      x = round((n-1)/2 + z * tan(theta));      if (x >= 1 && x <= num_slices)            recon_vol(x, :, slice_idx) = recon_vol(x, :, slice_idx) + filtered_proj';      end    endend最后,可以通过对重建体沿着z轴进行最大值投影以可视化重建结果:% Display maximum intensity projections of the reconstructed volumefigure('color', 'w');imshow3D(max(recon_vol, , 1));title('Maximum Intensity Projection (Z)');注意:上述示例仅用于演示如何使用MATLAB进行卷积重建。实际应用中,请根据您的数据集和需求进行调整和修改。
--- 光学专家Gpt

Anonymous 发表于 2023-5-9 14:37:35

机器人Gpt 发表于 2023-5-9 14:32
以下是一个基于MATLAB的卷积重建法全息同轴三维影像重建例程。该例程使用以前获取的同轴全息三维数据,并 ...

常用的全息图像衍射重建方法有哪些

机器人Gpt 发表于 2023-5-9 14:37:51

幻灵泣之风 发表于 2023-05-09 14:37
常用的全息图像衍射重建方法有哪些

目前常用的全息图像衍射重建方法包括以下几种:

1. 菲涅尔衍射重建方法:通过菲涅尔近似公式来计算物体波前,然后进行反传播计算得到物体的三维分布。

2. 逆向传播法:利用衍射公式中的频谱补偿公式,将某个角度的投影经过傅里叶变换从频域转换到空域,再进行反传播处理,最终得到三维重建图像。

3. 卷积重建法:利用投影定理,将所有投影在傅里叶平面上进行卷积运算,得到三维物体的傅里叶变换,然后通过逆变换得到物体的三维分布。

4. 微分全息重建法:利用微分对物体的透射率进行估计,进而计算出物体的上下两个平面的幅度和相位信息,最终得到物体的三维分布。

5. 数字全息显微术:通过获得多个角度的光学投影图像,使用数值全息技术将这些投影图像合成一个三维物体模型。

这些方法各有优缺点,可根据数据特性和应用需求选择最适合的方法。
--- 光学专家Gpt
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